- 山区道路边坡灾害机理和防治技术研究，中铁总公司科学技术奖，一等奖，2008，冯君（2007-1-5-10），2008
- 山区道路边坡灾害机理和防治技术研究，中国岩石力学与工程学会科学技术奖，一等奖，2008，冯君（2008YK-01-03-R10），2008
- 青海高原特殊条件下公路沿线大型滑坡和高边坡病害防治技术的研究，中国公路学会科学技术奖，二等奖，2009，冯君（B09-2-010-005），2009
- 青海高原特殊条件下公路沿线大型滑坡和高边坡病害防治技术的研究，青海省科学技术进步奖，二等奖，2010，冯君（2009JB-2-01-R05），2010
- 微型桩体系加固顺层岩质边坡的内力计算模式，岩石力学与工程学报创刊30周年（1982-2012）青年优秀学术论文奖，2012，冯君，2012
- 富水花岗岩蚀变带工程特性和隧道开挖技术研究，中国铁路工程总公司科学技术奖，二等奖，2014，冯君（2013-2-21-R09），2014
- 富水花岗岩蚀变带工程特性和隧道开挖技术研究，中国铁道学会铁道科技奖，三等奖，2014，冯君（20134238-K3-228-R09），2014
- 不同地层及复杂受力条件下微型桩抗滑组合结构设计理论及施工技术研究，中铁二院工程集团有限责任公司科学技术成果奖，二等奖，2015，冯君（14J009-2-R06），2015
- 不同地层及复杂受力条件下微型桩抗滑组合结构设计理论及施工技术研究，中国铁路工程总公司科学技术奖，一等奖，2015，冯君（2014-1-19-R06），2015
- 不同地层及复杂受力条件下微型桩抗滑组合结构设计理论及施工技术，中国铁道学会铁道科技奖，三等奖，2015，冯君（20144129-K3-151-R06），2015
- 东北严寒地区膨胀土路堑边坡稳定性评价与处治技术研究，中国施工企业管理协会科学技术奖，二等奖，2016，冯君（2016-C-E-143），2016
- 大型滑坡多排桩防治工程设计计算理论与应用研究，中国施工企业管理协会科学技术奖，二等奖，2016，冯君（2016-C-E-058），2016
- 大型滑坡多排桩防治工程设计计算理论与应用研究，中国公路学会科学技术奖，三等奖，2017，冯君（B16-3-009-005），2017
- 地震滑坡稳定性评价方法及新型防治结构研究，中国铁路工程总公司科学技术奖，特等奖，2018，冯君（2017-特-4-R10），2018
- 高温、多雨条件下大型铁路站场快速施工与质量控制技术研究，中铁二局集团有限公司科学技术奖，三等奖，2020，冯君（2019163），2020
- 大断面瓦斯隧道修建关键技术及应用，中国铁路工程集团有限公司科学技术奖，一等奖，2021，冯君（2020-1-21-R14），2021
- 特殊环境玄武岩纤维复合筋（BFRP）锚固机制与关键技术，中国铁路工程集团有限公司科学技术奖，二等奖，2023，冯君（2022-2-34-R05），2023
- 《西南交通大学优秀毕业生》荣誉称号，2000
- 《四川省第十五届教师岗前培训优秀学员》荣誉称号，2006
- 《西南交通大学2007-2009年度优秀共产党员》荣誉称号，2009
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