“渭河盆地现代构造活动和地质灾害灰色系统的研究”，获1989年度地质矿产部成果奖三等奖（排名第2），获奖名单：宫同伦、程谦恭、苏生瑞、丁莲芳。 指导研究生获奖：

“剧冲式高速岩质滑坡运动全过程动力学机制研究”博士学位论文，获2000年度陕西省优秀博士学位论文（排名第1），获奖名单：程谦恭，胡广韬；

“高速岩质滑坡动力学”学术专著，获1999年度优秀川版图书奖（排名第1），获奖名单：程谦恭、彭建兵、胡广韬、胡厚田；

“高速岩质滑坡动力学”学术专著，获2001年度第十届全国优秀科技图书三等奖（排名第1），获奖名单：程谦恭、彭建兵、胡广韬、胡厚田；

“郑西客运专线黄土隧道明洞高陡边坡变形机理及土钉支护参数研究”项目，获2009年度中国施工企业管理协会科学技术奖技术创新成果二等奖（排名第4），获奖名单：原郭兵、牛犇、王建亮、程谦恭、秦德进、程文斌、李卫东、胡国伟、张聪原、郑保才。

“观音堂隧道进口明洞段高边坡变形机理及桩钉复合支护技术研究”项目，获2009年度中国铁道建筑总公司科学技术奖二等奖（排名第4），获奖名单：张凤华、王亚军、胡建国、程谦恭、王晋生、霍玉华、张志军、董寿强、陈春华；

“黄土地区大跨度桥梁地下连续墙和箱型基础的应用研究”项目，获2008年度中交股份科学技术进步奖二等奖（排名第5），获奖名单：孟凡超、陈晓东、王宇鹏、张兴顺、程谦恭、龚维明、薛官玉、刘明虎、江剑虹、李永乐；

“云南省新平县地质灾害详细调查”项目，获2009年度国土资源科学技术奖二等奖（排名第4），获奖名单：陈红旗、田廷山、孟 晖、程谦恭、何政伟、王小东、薛群威、和怀忠、张小趁、陈亮；

“黄土地区大跨度桥梁地下连续墙和箱型基础的应用研究”项目，获2009年度中国公路学会科学技术奖二等奖（排名第5），获奖名单：孟凡超、陈晓东、王宇鹏、张兴顺、程谦恭、龚维明、薛官玉、刘明虎、江剑虹、李永乐；

2010年3月，程谦恭指导的文华的博士学位论文《湿陷性黄土地基中矩形闭合型地下连续墙桥梁基础负摩阻力作用机理研究》，被评为西南交通大学二〇〇九年度优秀博士学位论文；